西藏自治区第三人民医院于2013年建院，是西藏唯一的一家传染病专科医院，担负着西藏全区突发公共卫生事件应急处理及传染性疾病急、危重症、疑难病例会诊、转运、救治等医疗服务工作，同时，承担全区传染病防控技术指导、诊疗范本制定、临床科研、全区传染性疾病网络建设与管理、急救知识普及与传染性疾病防治培训等任务。并牵头成立了西藏传染病诊疗联盟、门静脉高压联盟。2021年建成西藏肺结核病影像筛查诊断中心。目前，正在开展重症肝病、耐药结核、传染病外科专科建设。